Роберт Алоян занял пост проректора Ивановской государственной архитектурно-строительной академии в 2012 году, после объединения этого ВУЗа и текстильной академии в политехнический университет, возглавил новое учебное заведение.
Должность эту он занимал до 2018 года. В том же 2018 году появилась информация о проверке финансовой деятельности учреждения в период руководства Роберта Алояна. Сам экс-ректор обвиняется в присвоении денежных средств, в том числе в виде начисления себе дополнительных стимулирующих выплат и премий.
При этом за время следствия сумма похищенных денег выросла от ста тысяч рублей до нескольких миллионов. В случае, если инкриминируемый ущерб превысит миллион рублей, подозреваемому грозит лишение свободы на срок до десяти лет.